按照实施细则规定，对于有违反管理办法或实施细则行为的中小企业或项目组织单位，财政部门将追回其已经取得的项目资金，外经贸部门将取消其申请资格，并在五年内不允许申请使用市场开拓资金；严重者将由外经贸部门和财政部门对该项目的主管人员和直接责任者给予行政处分，构成犯罪的提交司法部门依法追究刑事责任。