中小企业和项目组织单位申请市场开拓资金的程序可分为三个步骤：
　　第一步：项目资金计划申请：中小企业和项目组织单位应于每年7月1日至7月31日，按照实施细则所规定的支持内容分别向中小企业办公室或地方外经贸部门提出年度项目资金计划申请，内容包括：申请单位基本情况、申请报告、申请项目基本情况及相关资料等。
　　第二步：项目实施申请：中小企业和项目组织单位应根据外经贸部和财政部批复的年度项目资金计划，在项目具体实施30日前分别向中小企业办公室或地方外经贸部门提出项目实施申请，内容包括：项目实施申请、实施说明及相关资料等。
　　第三步：项目资金拨付申请：中小企业和项目组织单位在项目完成后一个月内，应分别向中小企业办公室或地方外经贸部门提出项目资金拨付申请。内容包括：项目资金拨付申请、项目总结报告、项目实际发生费用的合法凭证（复印件）等。